CATAMIND · RESEARCH WORKSPACE
从体系与目标，开启研究
从文献与方案到 DFT、验收、数据集和学习迭代。方案与试点确认后持续推进，异常留痕，目标以实算或实验证据验收。
文献与方案→试点验证→计算与数据→学习与迭代→目标验收
约束与预算（可选）
你的研究进展、阶段报告与待确认事项将在这里汇总。
资源与任务总览
按任务体系统一查看资源、执行状态与来源节点；展开详情核对依赖和证据。未匹配进程不表示任务结束。
正在读取…
GPU 设备
近期资源趋势
按来源查看任务操作
未关联平台任务的进程组
Codex 智能助手
连接本机 Codex · 继续已有会话，按所选权限处理任务；执行过程可展开查看
检测中…
👋 你好，我是接在本机 Codex 上的智能助手
可以直接用中文下指令：查平台数据、跑脚本、调服务器资源、修 bug、提交 CP2K 计算……
- 查一下平台知识库里有哪些 CP2K 参数经验
- 看看当前服务器上有哪些计算在跑、占了多少资源
- 帮我分析一个上传的结构文件（先点左下角 📎 上传）
研究体系 Systems
管理研究结构、组成、来源与已有描述符，为建模和计算提供数据。导入后先核对晶胞、原子顺序与标签定义。
体系列表
0结构查看器
未选择文献库 Literature
检索与归档研究文献，核验 DOI 和元数据，提取结构、方法与性能线索。AI 解读供辅助阅读，结论仍需核对原文。
自动从 CrossRef 获取元数据、从 OpenAlex / Semantic Scholar 拉取摘要；勾选「AI 解读」将用大模型提取材料体系、性能与结论并归档到知识库（需已配置模型）。
CP2K 知识库 Knowledge Base
检索 CP2K 设置、计算经验与来源资料，区分 官方规范 和 经验文章；用于方案设计与排错，需核对软件版本及材料适用条件。
ASE 结构生成 Builder
通过参数构建表面、合金、掺杂和吸附初始结构，预览后导出 CIF/XYZ 或保存到体系；计算前核对原子距离、周期边界和组成。
晶胞与表面参数
ASE · ase.buildÅ
Å
×
合金 / 掺杂
50%
1-based 原子序号（替换该原子）
吸附物种
Å · 距表面
如 5.0, 4.5 · 支持后续自定义位点
3D 预览
未生成
鼠标交互：
点击原子 → 设为掺杂位点
拖拽旋转 · 滚轮缩放 · 点击按当前模式生效
晶胞信息
| 尚未生成结构 |
CP2K 输入推荐 Recommender
结合结构与计算用途生成、编辑 CP2K 输入，并检查关键词。依赖已配置的生成工具；语法合法不等于参数已适用于当前材料，生产计算先做试点。
Multiwfn 生成输入文件
真实调用 Multiwfn自定义参数（可选，未添加的按 Multiwfn 默认）
可添加理论方法 / 基组 / 密度混合 / k 点网格 / SCCS 溶剂化 / TDDFT 等；仅填写的参数会传给 Multiwfn，其余保持默认。
Multiwfn 默认 PBE + DZVP-MOLOPT-SR-GTH + GTH-PBE + 350/50 Ry 截断，生成结果填入下方可编辑输入块，供学习各计算类型的默认参数设置。SCF 求解方法：Diagonalization（对角化，金属/带隙均适用）与 OT（Orbital Transformation，非金属带隙体系推荐，收敛快，不支持 smearing）。
可编辑输入块 · 实时校验
待校验
基组 / 赝势
统一：所有元素共用同一文件；逐个：不同元素可用不同文件与计算级别，&DFT 会按需列出多个文件名（CP2K 允许多个文件，不报错）。
全参数设置 Full Parameters
查询 CP2K 段落、关键词、默认值、单位与枚举。参数库依据 CP2K 2026.2 生成；使用其他版本时需核对兼容性。
SECTION 树
—请选择左侧 SECTION
实时校验预览 · 独立编辑器
待校验
与「输入推荐」的编辑器相互独立、互不影响，可在此独立编写并校验 CP2K 输入文本（实时高亮 + 行号 + 关键词合法性）；「导入结构」与输入推荐一致，从结构生成 / 内置示例导入结构生成输入文件。
计算任务 CP2K Tasks
配置与提交独立 CP2K 计算任务。运行状态、资源和任务操作已集中到资源与任务总览。
本平台已提交任务
0含「独立 CP2K 任务」（mpirun 直连，按 PID 杀进程树）与「工作流计算任务」（AiiDA，按 PK 调
verdi process kill）。点击停止即可终止对应进程。运行中的进程
0最近进程
0进程资源监控已移至顶部 CPU 卡片，可从任何模块打开。
CP2K 视图 CP2K View
浏览计算结构、轨迹、输入和输出；使用「异常诊断」定位失败证据、查看处理建议并下载报告。程序结束和 SCF 收敛均不能代替科学验收。
cp2k_runs/
CP2K 异常诊断
读取日志，定位异常证据并给出处理建议。支持服务器目录 / 文件或本地日志；不会启动计算。
后处理工具集
选择可用工具分析 PDOS、差分密度或 Bader 结果，核对来源、单位与质量；结果先预览，科学验收后再准入数据集。
正在加载工具…
任务与产物
后续扩展方向（尚未开放）
高通量筛选 HTS
组织结构优化、单点能与后处理批次，支持逐结构链式和波前并行。先验证方法与资源试点，再提交批次；执行状态和来源节点在统一总览查看。
计算工作流 · 平台已提交
0平台工作流任务：运行中可点■ 停止（终止其 AiiDA 计算，verdi process kill）；已终止/失败/完成的任务可点删除移除记录。
高通量批次
0批量工作流（ASE 批量结构 × 多步骤）：每行一个批次，点开可查看各结构计算状态；运行中可■ 终止，结束后可收集数据集（CSV 保存到提交时指定路径）或删除。
工作流结构 · 正在计算的结构
0展示活跃工作流的父子进程树：顶层 WorkChain → 中间节点 → 正在计算的 CP2K 结构（可点「详情」查看 PK 并检索）。
进程时间线
完成运行等待异常/终止
机器学习 ML
选择明确版本的数据集进行回归与多模型对比，查看交叉验证、分组留出和 SHAP。排名使用一致验证协议；SHAP 解释模型关联，不证明机理因果。
训练任务监控
0 个
训练以后台任务运行；GPU 是否使用及使用哪张卡，以模型结果中的实际设备为准。任务日志和控制操作集中在资源与任务总览。
最新完成结果 · 图表
正在读取最新完成任务…
数据来源与数据集构建
说明 · 点击展开▸
主动学习 Active Learning
基于多描述符预测与不确定性，按极值或目标区间筛选候选。无候选池时仅诊断或回放；推荐需经结构核验和计算/实验验证，不自动提交。
多描述符主动学习 · 最新结果
选择多描述符主动学习训练数据集后，在此查看验证、回放与候选。
主动学习任务监控
0 个旧版单描述符演示（独立数据源，不代表当前多维任务）
预测值 - 不确定性
GPR · RBF 核（浏览器拟合）下一批推荐结构
UCB 采集函数数据说明
来源 · 点击展开▸
功能状态：配置与历史记录可用。真实轨迹帧提取、标注验收和训练数据回流尚未接通，当前版本暂停生产提交。
势函数延拓 DPGEN
查看势函数延拓配置、历史记录和迭代明细。真实轨迹、标注验收及训练回流尚未完整接通，生产提交暂停；模拟结果不能作为势函数精度证据。
势函数延拓任务监控
0 个
此处保留历史任务与迭代记录。请核对运行模式和真实产物；mock 仅为开发模拟，不能视为已完成高精度标注或训练。
迭代明细
未选择点击任务「明细」查看逐轮迭代、训练/验证误差与 CP2K 标注任务。